至于募集资金效果，深交所分析认为与预期进度与效果有差距。2006年之前上市的前50家公司已累计使用募集资金的金额占总募集资金金额的比例为75.72％，符合计划投资进度的募集资金项目个数占总项目个数的比例为66.24％，符合预计收益的募集资金项目个数占总项目个数的比例为61.18％。深交所指出，虽然大部分公司募集资金项目为公司贡献了良好的收益，但仍有部分公司募集资金项目未达到预期进度和效果，甚至有少数公司募集资金全部投入了较长时间但仍未产生明显经济效益。在激烈的市场竞争环境下，募集资金项目不能达到预期收益，产品更新换代跟不上，直接影响公司的成长性。

　　独立性受干扰存在违规苗头

　　深交所表示，虽然中小板一直高度重视上市公司治理，先后发布了多项规定、指引、细则，督促上市公司加强各项制度的建立和落实，也特别注重树立上市公司的规范运作意识，并收到良好的效果，但中小板公司治理仍有待完善，其规范运作水平仍有待进一步提高。

　　深交所在监管中发现，仍有部分上市公司的控股股东或实际控制人干预公司管理层的人事任免、直接干涉公司经营业务活动、通过多种非正常途径获取上市公司未公开的重大信息等问题。这些行为影响了上市公司的独立性，容易产生侵占上市公司利益、内幕交易等违规行为。

　　与此同时，深交所还从中小板公司2006年年度报告中发现，个别公司存在违规事实或苗头，如隐瞒日常关联交易的行为、对外担保事项未履行相应的审批程序和信息披露义务、有关财务数据和表述存在低级错漏现象。

　　[金融界网站简评]：尽管中小板上市公司2006年年报交出一份满意的答卷，但深交所指出，中小板上市公司所处行业普遍面临激烈的市场竞争，少数公司募集资金使用效果不佳，业绩波动风险较大，并存在公司治理结构不完善、规范运作意识不强等五大问题，需要投资者充分关注。